В городской парламент Петербурга 26 мая 2004 г. поступило повторное обращение Министерства транспорта РФ о согласовании реорганизации Государственной морской академии им.Макарова путем присоединения в качестве структурного подразделения Государственного среднего профессионального учреждения "Морской колледж".
По первому обращению собранием было принято постановление, согласно которому предлагаемая реорганизация признавалась нецелесообразной - из-за планируемого перемещения Колледжа (после его реорганизации) в новый, еще не достроенный корпус Академии в пос.Стрельна. Однако в связи с поддержкой идеи о реорганизации нынешним руководством колледжа, собрание в целом приняло постановление, признающее указанную реорганизацию целесообразной.
По мнению депутатов ЗС Петербурга, предлагаемая реорганизация направлена на оптимизацию сети морских учебных заведений и приведет к сокращению расходов на их содержание.